Das ist das Standardverhalten, wenn ein Artikel in zwei Kategorien verlinkt wird. Sonst hättest Du ja auch quasi internen Duplicate Content, also quasi eine Seite, die mit zwei URLs aufzurufen wäre?Klickt man aber nun auf den Artikel in Kategorie 3 wird automatisch der Link von Kategorie 1 genommen.
Wobei das mit der Sitemap dann auch nicht sein sollte. Ich schau mal nach.